De vijftienjarige Deena Marten wil dezelfde vrijheid waar elke tiener naar hunkert. Maar als ze haar zin niet kan krijgen, barst haar rebelse temperament los in geweld. Haar ouders, Cynthia en Todd, vrezen dat haar nieuwe vriend, Garret, 17, de oorzaak is. Radeloos, Stephanie wendt zich tot alcohol, en Todd ontsnapt in zijn werk. Ze zijn zich er niet van bewust dat hun padvinderszoon Adam, 13, drinkt uit een fles wodka die verborgen ligt in zijn slaapkamer. En de problemen in dit disfunctionele gezin blijven verergeren.
Een onderwijzeres uit een kleine stad wordt opgejaagd door een voorwaardelijk vrijgelaten oplichter die het geheim van haar duistere verleden met zich meedraagt.
Tijdens de pauze van een voorstelling wordt danseres Sally doodgeschoten en kort daarna wordt ook het lijk van pooier en dealer Paco gevonden. De twee slachtoffers zijn met hetzelfde wapen vermoord, en de agenten Carella en Meyer ontdekken dat ze ooit een relatie hadden.
De film begint zes jaar na de serie. Alf is gevangen door de Alien Task Force en wordt nu vastgehouden in een geheime basis in de woestijn (gelijk aan Area 51). Het leger houdt hem nauw in de gaten. Wanneer blijkt dat het project zal worden gesloten, geeft kolonel Milfoil het bevel Alf te laten executeren. Twee medewerkers van het project, Dr. Rick Mullican en Dr. Melissa Hill, besluiten Alf te redden. Ze smokkelen hem de basis uit en nemen hem mee naar een paar collega-wetenschappers. Die willen Alf aan de hele wereld tonen.