Mia is een jong meisje met de gave om zichzelf in de problemen te brengen. Op een avond, wanneer haar moeder in slaap valt terwijl ze haar 'Duimelijntje' voorleest, verandert Mia op magische wijze in het vijf centimeter lange personage. Terwijl ze door 'het onbekende land van Wonderland' reist, wordt Mia gedwongen obstakels te overwinnen die haar helpen als persoon te groeien.
Het geheim van de schat van de familie Lupin is bekend: de locatie is geschreven in een woordenboek dat ooit in het bezit was van Napoleon Bonaparte zelf! Wanneer het woordenboek opduikt als de prijs voor een historische autorace, racen de beruchte Lupin de Derde en zijn criminele kader tegen de supermachten van de wereld om het woordenboek te winnen - of te stelen - en de erfenis van zijn grootvader op te graven!
De allereerste Gear die ooit ter wereld is gemaakt, wordt gestolen. Het toestel, genaamd Kaiservern, verslaat de prijswinnaars van de Australische conventie één voor één. Kouya en Manganji, die een prijs hebben gewonnen op de Azië-conventie, worden ook doelwitten. Wanneer de onbekende uitrustingsjager die Kaiservern afhandelt voor Kouya en Manganji verschijnt, besluiten de twee jongens samen te vechten om de overwinning op hun vijand te behalen.
Cyborg 009 en zijn team worden herenigd om de nieuwste dreiging van de Black Ghost te bestrijden. Voordat ze hun vijand kunnen verslaan, moet het team een leger monsters overwinnen dat is gestuurd om hen tegen te houden, waaronder gigantische kwallen, pijlstaartroggen, plesiosauriërs en verraderlijke cyborgs.