Mutanten, mensen met een afwijkende genetische opmaak, die hen zeer bijzondere krachten geeft. Sommige mensen zien het als een geschenk uit de hemel, anderen als een vloek. Professor Charles Xavier en zijn team behoren tot die eerste groep en proberen op Xavier's school jonge mutanten te laten opgroeien met hun speciale krachten. Maar niet iedere mutant gebruikt zijn krachten voor goede doeleinden. Zo wil de mensenhatende Eric Lensherr, alias Magneto, zijn krachten gebruiken om de mensheid uit te roeien. Het is aan Xavier en zijn team om Magneto te stoppen.
Aan boord van de Nightingale 229 bevindt zich een vreemde aanwezigheid. Het is een dreigend onbekend iets dat door Karl Larson aan boord werd gesmokkeld. Karl werd door de bemanning opgepikt in de buurt van een verlaten mijn. De astronauten krijgen niet lang de tijd om dat te betreuren want één na één komen ze op een gewelddadige manier aan hun eind. Voor het zover is wordt er nog driftig heen en weer gelopen door smalle gangen, verlicht door fotogenieke lichtjes. De confrontatie aan het einde van de reis zou wel eens bepalend kunnen zijn voor het voortbestaan van de aarde.
Meer dan honderd jaar geleden stortte een cataclysmische reeks gebeurtenissen de aarde in de donkere middeleeuwen die het grootste deel van de beschaving verwoestten, en de overgebleven weinige overlevenden proberen de loop van de gebeurtenissen die tot de vernietiging hebben geleid, te veranderen.
Dr. Sheila Casper, een zoöloge die vleermuizen bestudeert, wordt samen met haar assistent Jimmy naar Gallup, een slaperig stadje in een woestijnachtige streek van Texas, geroepen. Wanneer de nacht er valt, vliegen grote zwermen vleermuizen de stad binnen en vallen alle levende wezens die ze tegenkomen aan. Sheila en Jimmy proberen samen met sheriff Emmett Kimsey een manier te vinden om de vleermuizen tegen te houden.
Wanneer een groep terroristen de wereld op de rand van oorlog weten te brengen, stelt de ster van het futuristische Futuresport, Tre Ramzey (Dean Cain), voor om een wedstrijd te houden met de terroristen om zo de verschillen uit te kunnen vechten. Hierbij krijgt hij hulp van journaliste Alex Torres (Vanessa Williams) en Obike Fixx (Wesley Snipes), de bedenker van de sport.