De gebeurtenissen vinden plaats in 1990. Buitenaardse wezens nemen via de radio contact op met de aarde en kondigen hun aanstaande aankomst aan. Maar hun schip stort neer op de planeet Mars. Een team astronauten wordt vanaf de aarde gestuurd om hen te helpen. Een alien wordt dan gevonden...
Een zware condensatie van de originele serie comprimeert de originele dertien afleveringen tot een efficiënte speelfilm van 97 minuten. Een ramp lijkt dreigend wanneer wetenschappers ontdekken dat de planeet Mongo op het punt staat op de aarde te storten. Gelukkig staat de heldhaftige jonge Flash Gordon klaar om een onderzoeksmissie naar de ruimte en naar de snel naderende planeet te leiden. Daar ontdekken hij en Dale, die meegaat, dat Ming, de sluwe heerser van Mongo, de planeet met opzet op ramkoers met de aarde heeft gezet, en alleen Flash kan hem tegenhouden.
Astronauten Glenn en Fuji onderzoeken Planeet X en ontmoeten mysterieuze buitenaardse wezens die bekend staan als de Xiliens, die de mensen op aarde vragen om hun wereld te redden van 'Monster Zero'. In ruil voor het lenen van Godzilla en Rodan bieden de Xiliens een geneesmiddel tegen kanker aan. Terwijl Glenn onderzoek doet, ontwikkelt hij een romance met juffrouw Namikawa en ontdekt hij de ware bedoelingen van de Xilien.
In de 21ste eeuw wordt de populatie van de maatschappij in stand gehouden door middel van gelegaliseerde moord. Er ontstaat een moordspel waarvan de laatst overgeblevene de winnaar zal zijn.
Wanneer een atoomoorlog op Mars de vrouwen van de planeet vernietigt, is het aan Martian Princess Marcuzan en haar rechterhand Dr. Nadir om naar de aarde te reizen en vrouwen te ontvoeren voor voortplanting. Ze landen in Puerto Rico en schieten een NASA-ruimtecapsule neer die wordt bemand door een androïde. Nu zijn elektronische hersenen beschadigd zijn, terroriseert de androïde het eiland terwijl de marsmannetjes stranden en zwembadfeesten plunderen
In de toekomst moeten twee ruimteschepen, Argos en Galliot, de duistere planeet Aura onderzoeken. Als de Galliot op de planeet landt begint de crew elkaar plotseling aan te vallen. De crew ontdekte de gecrashte Argos, en ontdekt dat de crew van dat schip overleed door onderlinge gevechten.
Lemmy Caution is een Amerikaanse detective die op een dag arriveert in de futuristische stad Alphaville op een andere planeet. Zijn karakter botst echter met de plaatselijke wetten, die liefde en zelfontplooiing verbieden.
Dr. Stephen Sorenson wil de warmte uit het binnenste van de aarde gebruiken voor energie, maar als een experiment mislukt, ontstaat er een diepe kloof die steeds groter wordt. Sorenson staat nu voor de moeilijke taak om dit proces te stoppen, omdat de aarde anders in tweeën zal splijten.
Nadat een meteoriet een driekoppig beest op Tokio heeft losgelaten, probeert Mothra zich te verenigen met Godzilla en Rodan om de buitenaardse dreiging te bestrijden.