August trekt zich terug uit het missionarisschap, nadat zijn geliefde zus Christina is overleden. Christina was een bekende porno-ster, bekend als 'The Princess', die ten onder is gegaan aan de drugs. August voelt zich verplicht om voor Christina's 5-jarige dochtertje Mia te zorgen. Samen met Mia trekt August op een gewelddadige kruistocht om al het pornografische materiaal van Christina te vernietigen.
Het is het jaar 2030. Zes maanden zijn verstreken sinds het Laughing Man Incident werd opgelost. Er leven ongeveer 3 miljoen vluchtelingen in Japan, uitgenodigd om het tekort aan arbeidskrachten op te vullen. De opkomende aanwezigheid van de uitgenodigde vluchtelingen intensiveerde echter hun confrontatie met de 'individualisten', die opriepen tot nationaal isolement, wat vervolgens leidde tot een toename van het aantal terroristische aanslagen. Onder deze omstandigheden voert een terroristische groepering genaamd de Individual Eleven een zelfmoordaanslag uit. Maar er zat een groter plan achter hun actie. Wanneer Sectie 9 dit verneemt, proberen ze het brein van het incident te achterhalen. Ondertussen wordt Kuze, een overlevend lid van de Individual Eleven, een charismatische leider van de uitgenodigde vluchtelingen en intensiveert hij de confrontatie met de regering. En Motoko begint een vreemd gevoel te krijgen dat haar met Kuze verbindt...
Op een dag komt een stukje van de hemel naar beneden... en wie is de redder in nood? Chicken Little bedenkt samen met zijn maffe vriendjes een plan om de wereld voor de totale ondergang te behoeden. Hij bewijst aan iedereen dat de grootste held op aarde best een klein kippetje kan zijn.