Lelouch alias Zero staat met zijn rug tegen de muur: niet alleen is zijn kleine zusje Nunnally, die alles voor hem betekent, ontvoerd en zijn voormalige beste vriend Suzaku negeert al zijn hulpkreten, ook de Orde van de Zwarte Ridders lijkt te zijn langzaam het vertrouwen in hun leider verliezen. Lelouchs hoop om zijn vader, de keizer, omver te werpen, vervaagt. De enige optie die hem rest in dit alles-of-niets-politieke schaakspel is het verslaan van het imperium dat hij van binnenuit haat. Maar in deze laatste beslissende strijd zal hij niet alleen het hoofd moeten bieden aan zijn tirannieke vader, maar ook aan zijn moeder, waarvan men dacht dat ze dood was, en Nunnally, die zich heeft afgekeerd van Lelouch...
Mizore en Nozomi zijn beste vrienden, die bezig zijn aan hun laatste schooljaar. Beide zijn ze bezeten van de brassband club van hun school. Met Mizore op de oboe en Nozomi op de fluit, brengen ze hun dagen door in geluk, totdat de club liedjes begint te oefenen geïnspireerd op het sprookje van 'Liz and the Blue Bird'.
Maquia stopt, net zoals de gemeenschap waarin ze leeft, met ouder worden vanaf de puberteit waardoor ze honderden jaren oud kan worden. Ondanks dat het een warme omgeving is op een afgelegen eiland voelt Maquia zich eenzaam.
In een meedogenloze oorlog verplettert het Heilige Britse Rijk de Japanse strijdkrachten en verovert het land snel. Als gevolg van deze nederlaag verliest Japan zijn onafhankelijkheid en wordt het de elfde kolonie van de wereldmacht. Van nu af aan worden de Japanners ‘Elevens’ genoemd, opeengepakt in getto’s en ontdaan van alle fundamentele rechten. Maar er is verzet tegen de bezetters: Lelouch, afgewezen door zijn vader, de keizer van het Britse rijk, en gedeporteerd naar Japan, wil de grote macht vernietigen. Met behulp van de bovennatuurlijke kracht van Geass, de kracht van koningen, kan hij iedereen zijn bevel laten gehoorzamen. Voor Lelouch begint een ongelooflijk schaakspel tegen zijn eigen vaderland, waarin de Elfen, de Britse soldaten en de Japanse rebellen de stukken vertegenwoordigen...
Na hun succes in de kwalificatieronde voor de Kansai-regiowedstrijd, richt de harmonie van de Kitauji High School zich op hun volgende optreden. Ze benutten hun zomervakantie optimaal door deel te nemen aan een trainingskamp onder leiding van hun bandleider Noboru Taki en zijn professionele muzikantenvrienden. Kumiko Oumae en haar vrienden blijven vastberaden om goud te halen op de Kansai-wedstrijd. Problemen ontstaan echter wanneer een voormalig bandlid interesse toont om weer toe te treden, wat onaangename herinneringen oproept bij de tweedejaars. Bovendien komt Kumiko meer te weten over het verrassende verleden van haar leraar en de motivatie achter zijn wens om de band naar de overwinning te leiden. Het bereiken van de nationale kampioenschappen vereist hard werk en de onverzettelijke toewijding van elke student zal op de proef worden gesteld.
Rin Matsuoka houdt van zwemmen! Vooral zijn jeugdvriend Haruka wil hij koste wat kost verslaan. Maar dan komt zijn oude vriend Sosuke opdagen, hij is een eenzame vechter en wil Rin ervan overtuigen zich op zichzelf te concentreren. Voor iedereen breekt een turbulente tijd aan, waarin zij moeten beseffen wat voor hen werkelijk telt.
Haruka Nanase houdt van water! Samen met zijn vrienden Makoto, Nagisa en Rei richt hij de Iwatobi Swimming Club op, waar hij vrijelijk zijn eigen zwemstijl kan ontwikkelen. Samen met hun oude vriend Rin en zijn team van de Samezuka Swimming Club doen ze mee aan een grote verscheidenheid aan competities. Maar wat gebeurt er met het team nadat ze van school zijn afgestudeerd?
Mitsuha is de dochter van de burgemeester van een klein bergdorpje. Ze is een studente die samen met haar zus bij haar grootmoeder woont. Ze is erg ongeïnteresseerd in de shinto-rituelen en heeft geen zin om haar vader te helpen met de verkiezingsstrijd.
Na een traumatische ervaring tijdens een regionale blazersbandcompetitie op de middelbare school, zweert euphoniumspeelster Kumiko Oumae de muziek af. Ze hoopt op een frisse start op de middelbare school. Maar het lot beschikt anders, want ze wordt omringd door mensen met een passie voor de schoolharmonie. Met de hulp van haar bandleden, zowel nieuwelingen als ervaren muzikanten, vindt Kumiko de motivatie om weer muziek te maken. Echter, binnen de band heerst pure chaos. Ondanks hun ambitie om zich te kwalificeren voor het nationale blazersbandkampioenschap, is zelfs deelname aan het lokale festival op dit moment een hele uitdaging. Tenzij de nieuwe bandleider, Noboru Taki, ingrijpt...
Een drijvende ruimte zonder zwaartekracht, waar een oneindig aantal lampen schijnen in verschillende kleuren: De Doos van de Wijsheid. Binnen dit kader zijn er meerdere werelden, meerdere tijdlijnen en daar waren vele verschillende mensen. Dit is waar Dual en Dorothy vechten met vijanden genaamd Virussen. Werelden geïnfecteerd door virussen moeten worden gewist. Dat is de taak, de taak van deze meisjes. Echter, op een dag, voelen Dual en Dorothy de aanwezigheid van een nieuw virus. Aangekomen op de locatie van het virus, zien ze een meisje dat wordt aangevallen door virussen. Na het redden van het meisje, wacht het duo tot ze ontwaakt, en kunnen ze vragen wie ze is, waar ze vandaan komt en waar ze heen gaat. Wanneer het meisje wakker wordt, zegt ze dat ze haar naam Rimo is en fluistert slechts één zin: "Ik moet terug naar de bloem patch."
Haruka heeft een heel bijzondere band met water en zwemmen. De estafettewedstrijd op de basisschool is zijn laatste race voordat hij met Makoto naar de middelbare school gaat en aan een nieuw hoofdstuk in zijn leven begint. Uiteraard sluiten ze beiden meteen weer aan bij het zwemteam en vormen ze samen met Asahi Shiina en Ikuya Kirishima een team voor estafettewedstrijden. Al snel wordt duidelijk dat elk van de vier heel verschillende motivaties en doelen heeft, wat vaak tot problemen leidt tijdens de training.
Na de dood van zijn moeder leeft de jonge Ren op straat. Opgejaagd door de politie vlucht hij een steegje in en komt terecht in de dierenwereld. Daar wordt hij de succesvolle leerling van de krijger Kumatetsu. Als hij de weg naar Tokio terugvindt, gaat hij zijn vader zoeken.
Sawa (India Eisley) woont in een mislukte staat waar een corrupte beveiligingsdienst geld verdient met vrouwenhandel. Wanneer haar vader, die een politieagent is, vermoord wordt staat ze er op om de moordenaar te vinden. Ze krijgt hierbij hulp van zijn voormalige partner Karl Aker (Samuel L. Jackson).