Het kunnen zien van geesten en andere bovennatuurlijke geesten is een zware verantwoordelijkheid. Prins Lee Rin (Jung Il Woo) ontdekt, net als zijn vader vóór hem, dat hij het vermogen heeft om geesten en andere bovennatuurlijke wezens te zien. Gewapend met zijn nieuwe vaardigheden wordt Lee Rin de leider van een groep nachtwakers die van zonsondergang tot zonsopgang door de straten patrouilleren om de mensen van de Chosun-dynastie te beschermen tegen kwade geesten. Moo Seok (Jung Yun Ho) is de beste zwaardvechter van het land en de trouwe lijfwacht van de prins. Maar hun loyaliteit zal op de proef worden gesteld wanneer ze allebei verliefd worden op dezelfde vrouw: Do Ha (Go Sung Hee), de opvolger van de Ma Go-stam die hun hulp zoekt om de geesten van de Baek Do-berg te beschermen. Maar Park Soo Ryun (Seo Ye Ji), de dochter van een gerechtsofficier, deinst voor niets terug om met prins Lee Rin te trouwen. 'De Nachtwaker', ook wel 'Dagboek van een Nachtwaker' genoemd,
Elida, een weeskoningin die weigert haar ware titel te accepteren, geeft er de voorkeur aan om door de Melkweg te speuren en in de problemen te komen terwijl de regering van de Republiek haar koninklijke bloedlijn probeert uit te roeien. Elida's bestaan staat op zijn kop als haar oude vriend Isaac beweert dat Elida's moeder, Xevelyn, nog leeft.
Het speelt zich af aan het eind van de jaren tachtig, de school is uit voor de zomer, en een zonovergoten seizoen vol primeurs lonkt de begeleiders van Camp Clearwater, een ogenschijnlijk idyllisch zomerkamp in het Midwesten, inclusief eerste liefdes, eerste kussen – en eerste moorden. De duistere, eeuwenoude mythologie van Clearwater ontwaakt, en wat een zomer vol plezier had moeten zijn, verandert al snel in een zomer vol onvergetelijke angsten en kwaad bij elke bocht.
Het verhaal begint wanneer middelbare scholier Kazuki Muto op een nacht wordt vermoord door een mysterieus meisje te redden van een monster, maar hij wordt wakker in zijn studentenhuis en denkt dat het een droom is geweest; Hij komt er echter al snel achter dat de droom helemaal geen droom was wanneer een gigantisch slangachtig monster hem en zijn zus aanvalt. Tokiko Tsumura, het meisje dat hij heeft gered, legt uit dat het monster een homunculus is. Kazuki was erdoor aangevallen en gedood toen hij haar aan het redden was; Ze voelde zich echter verantwoordelijk voor hem en bracht hem weer tot leven door een Kakugane-medaillon in zijn borst te plaatsen, dat als vervangend hart diende.