Het verhaal volgt de hoofdpersoon die op een dag wakker wordt en getransformeerd wordt als Pochita, een hond van zijn coole en mooie klasgenoot Karen Inukai.
Generator Rex, een gemiddelde tiener met het vermogen om zijn lichaam in geweldige machines te veranderen, helpt de geheime organisatie Providence de wereld te redden van de nanietdreiging en gevaarlijke EVO-monsters.
Trigun speelt zich af in de verre toekomst op een woestijnplaneet. Vash the Stampede is een revolverheld met een legende die zo meedogenloos is dat hij een premie van $ 60.000.000.000 op zijn hoofd heeft staan. Hele steden worden geëvacueerd bij het gerucht over zijn komst. Maar de echte Vash the Stampede, het enigmatische en conflicterende hoofdpersonage, is heldhaftiger, ook al gedraagt hij zich meestal als een volslagen idioot.