Het Galactische Rijk is gevallen. De voormalige jedi-strijder Ahsoka Tano moet een opdoemende bedrijging voor een kwetsbaar heelal onderzoeken. Hiertoe reist ze van het ene einde van dit heelal nar het andere, op zoek naar grootadmiraal Thrawn, een voormalige commandant in het voormalige Galactische Rijk.
Monkey Typhoon vertelt het verhaal van drie asobots – een vorm van robots waarvan de algemene titel een samenvoeging is van de woorden associatie en robot – Goku, Tongo en Joe. Ze worden tijdens hun reizen bijgestaan door Sanzo, een mens, de zoon van de maker van de asobots, en Suzie, die zich bij hen voegde nadat haar vader was genezen van het vernietigingsvirus. Later worden ze vergezeld door hun voormalige rivalen Miyon en Shiyon. Hun zoektocht is om de vernietiging van hun wereld te stoppen door de legendarische 49 sleutels te verzamelen om de Tokyo Metropolitan Government te ontgrendelen. Gaandeweg krijgen de asobots het vermogen om verder te evolueren. Samen komen ze tijdens hun vele reizen verschillende vijanden en vijanden tegen, zoals Loki, Ryutaro Demon, het Kwartet, koning Doberman Pinscher en nog veel meer, en groeien ze verenigd in hun vriendschap.
Overdag zijn de Duncans een vooraanstaande familie die een bloeiende exotische autodealer in New York runnen. 's Nachts leiden ze een gevaarlijk geheim leven. Wanneer ze belegerd worden, zullen de Duncans bij elkaar moeten blijven of afzonderlijk sterven.