Kana, 17, brengt graag tijd door met haar vrienden Mossan, Hijiri en Pets. Ze hebben het naar hun zin totdat er op een dag een mecha uit de lucht valt met een vreemde vrouw, Haruko. Ze zal Kana en haar vrienden kennis laten maken met een strijdmacht genaamd ATOMSK. Kana zal dan moeten beslissen of ze hem wil helpen of niet, maar heeft ze echt een keuze?
Professor Nishiyama realiseert zich, na het bestuderen en interpreteren van de profetieën van Nostradamus, dat het einde van de wereld nabij is. Helaas luistert niemand naar hem totdat het te laat is. Terwijl de gevolgen van het geknoei met de aarde door de mensheid – radioactieve smogwolken, afschuwelijk gemuteerde dieren, vernietiging van de ozonlaag – uit de hand lopen, stormen de wereldleiders blindelings op de uiteindelijke confrontatie af. De film veroorzaakte controverse in Japan en werd vervolgens uit de circulatie gehaald, zonder officiële videorelease van de onversneden film.
In de Tweede Wereldoorlog gebruikte Captain Invincible zijn superkrachten tegen de nazi's en werd hij geprezen als een held. Maar toen hij werd beschuldigd van verraad, trok hij zich in ongenade terug naar Australië. Terug naar het heden, wanneer een Amerikaans supergeheim superwapen wordt gestolen en hij wordt gevraagd terug te komen naar de Verenigde Staten om het kwaad te helpen stoppen en zijn goede reputatie te herstellen. Helaas is Captain Invincible nu een dronkaard...
Vanuit de toekomst gestuurd om voor een eenzaam meisje te zorgen, valt Eggy voor haar. Maar afspraakjes zijn verboden en zouden hun beider lot in gevaar brengen.