Sovjet wetenschapper Petrovich baant zich een weg naar de zon, maar er wordt nooit meer iets van zijn ruimtevaartuig vernomen. Later onderzoekt Andrews laboratorium middelen ter bescherming tegen dodelijke straling. Andrew herhaalt de reis van Petrovich en biedt zijn leven aan om een in een baan rond de aarde draaiend wetenschappelijk laboratorium te redden, dat de oplossing voor het probleem bevat.
Wanneer een atoomoorlog op Mars de vrouwen van de planeet vernietigt, is het aan Martian Princess Marcuzan en haar rechterhand Dr. Nadir om naar de aarde te reizen en vrouwen te ontvoeren voor voortplanting. Ze landen in Puerto Rico en schieten een NASA-ruimtecapsule neer die wordt bemand door een androïde. Nu zijn elektronische hersenen beschadigd zijn, terroriseert de androïde het eiland terwijl de marsmannetjes stranden en zwembadfeesten plunderen
Het verhaal gaat over Sam, een jongen die bijkomt in een drukke metro, maar niet weet wat zijn naam is en hoe hij daar terecht is gekomen. Met behulp van Lara, die hij ontmoet in de metro, gaat hij op zoek naar zijn identiteit. Samen proberen ze het raadsel op te lossen, maar gaandeweg blijkt dat hij in groot gevaar verkeert.
Neem de personages uit een aantal op sciencefiction gebaseerde animes, een podium dat lijkt op 'Wacky Races', super vervormde waanzin en algemene waanzin, en wat je krijgt is Scramble Wars. Hoewel Scramble Wars personages bevat uit de originele Bubblegum Crisis, Gall Force en Genesis Survivor Gaiarth, bevat het ook een paar andere personages uit andere animes zoals AD Police en Riding Bean.