New York, 1855. Lucky Luke escorteert de Daltons voor het zoveelste proces. Onvermijdelijk slaat het viertal op de vlucht en plunderen ze nadien talrijke banken. Met de politie op de hielen verbergt Joe Dalton de buit in de woonwagen van een stel immigranten die naar Californië vertrekken. Deze mensen zijn blijkbaar het slachtoffer van een schaamteloze oplichter en hebben maar tachtig dagen om hun grondgebied in Californië op te eisen. De eenzame cowboy besluit de moedige immigranten te helpen en hoopt ook de vinnige Daltons weer in te kunnen rekenen.
Het verhaal van de anime speelt zich af in het jaar 2202, drie jaar na de terugkeer van de Yamato van de planeet Iscandar. De mensen op aarde herstelden hun planeet met het Cosmo Reverse System en tekenden een vredesverdrag met Garmillas. Naast de wederopbouw heeft de aarde een nieuwe verdedigingsvloot ontwikkeld, waaronder het ultramoderne slagschip Andromeda. De aarde bewandelt een pad van militaire expansie, ondanks de wensen van Starsha Iscandar. De Yamato helpt deze zogenaamde vrede te verwezenlijken, maar dit gaat ten koste van vele onschatbare offers. De godin Teresa, die bidt voor rust in de ruimte, roept de Yamato op voor een nieuwe reis. De dreiging van Gatlantis raast over het universum en nadert de aarde.