Om een behoefte aan vrijheid te bevredigen, besluit Teddy om weg te gaan van het lawaai van de wereld en vestigt hij zich in een hut aan de bevroren oevers van het Baikalmeer. Op een avond, wanneer hij de weg verliest in een sneeuwstorm, wordt hij gered door Aleksei, een Rus op de vlucht.
Slechterik Shredder ontsnapt uit hechtenis en sluit zich aan bij de gestoorde wetenschapper Baxter Stockman en zijn twee onnozele handlangers, Bebop en Rocksteady. De Turtles proberen het duivelse plan van Shredder en zijn nieuwe crew om de wereld over te nemen tegen te houden, maar dan komt er nog groter kwaad op hun pad: de beruchte Krang.
Een jong meisje wordt door een grote reus, beter bekend als de GVR, geïntroduceerd in de wondere wereld van Reuzenland. De GVR, zelf een grote vriendelijke reus, is niets vergeleken met de andere reuzen die er leven.