In een sterrenstelsel ver weg is er een kind zonder aangeboren vermogen om interne technieken te oefenen. Om het respect van zijn vader te winnen, kiest hij er dus resoluut voor om het moeilijkere en pijnlijkere pad te volgen: het beoefenen van externe technieken. Naarmate de jaren verstrijken, groeit hij op, maar wat zijn leven echt verandert is een mysterieuze meteorische kristalsteen: de Meteoric Tear. Deze steen versmelt ongemerkt met het lichaam van de jongeman, waardoor hij drastische transformaties lijkt te ondergaan. Daarna is alles veranderd. Uiteindelijk komt zijn vader erachter dat de zoon voor wie hij niet echt veel aandacht heeft besteed, over verbazingwekkende capaciteiten beschikt. En er komt nog veel meer.
Misha is een klein meisje dat op jonge leeftijd haar moeder verloor en nu bij haar vader woont. Haar vader heeft een dienstmeisje in dienst genaamd Tsubame, een voormalig ambtenaar van de Zelfverdedigingsmacht, en ook een lolicon.
Tadashi Satomi is een virtueel idool onder de naam μ, en haar missie is om de bittere gevoelens en ontevredenheid van haar gebruikers te bevredigen. Ze gelooft dat de mensheid voortdurend moet lijden en daarom lokt ze met haar muziek mensen naar de virtuele wereld van Mobius. Maar dat is voor haar niet genoeg: ze sluit mensen op in deze wereld zodat ze bevrijd worden van het lijden van de werkelijkheid en al hun wensen uitkomen.
Het Gunpla Force Battle Tournament is een groot evenement dat één keer per jaar in GBN wordt gehouden. In de laatste ronde strijden Avalon, geleid door kampioen Kyoya Kujo, en de elite 7e Panzerdivisie onder leiding van de sluwe Rommel. Beginnend met Kyoya's Gundam AGE II Magnum, gaan verschillende Gunpla het veld op om te bepalen welke de sterkste kracht is!
In een welvarende stad genaamd Russell City begint zich een voorteken af te tekenen dat de wereld dreigt te doen wankelen. Een man genaamd Sword is de eerste die de eerste aanwijzingen van het complot hoort, en stort zichzelf in een schaduwoorlog om het bloot te leggen. Zijn enige aanwijzing is het sleutelwoord 'El Dorado.' Hij ontmoet Sophie, een vrouw die op zoek is naar haar vermiste oudere broer, die haar alleen maar achterlaat met dezelfde woorden: 'El Dorado.' Nu Sword in het verleden ook zijn jongere zus heeft verloren, worden beiden tot elkaar aangetrokken door de woorden en werken ze samen om de betekenis ervan te achterhalen.
Een groep tieners bundelt hun krachten met de Avengers, de machtigste helden van de aarde, om te vechten tegen de tirannieke Loki en zijn machtige rijk.