Nadat een meteoor de aarde heeft getroffen, hebben verraderlijke troepen (in alle opzichten) de macht overgenomen en lijden de mensen. In de chaos krijgt een jongen genaamd Tetsuro Daiba, die zijn ouders had verloren bij de meteoorinslag, bezoek van Mello, een mysterieuze vrouw die in een helder licht verschijnt. Als Daiba bijkomt, bevindt hij zich in een ruimteschipziekenhuis onder observatie. Hij steelt een gevechtsvliegtuig waarvan hij niet wist hoe hij het moest besturen (totdat hij het probeerde), hij breekt uit en vliegt als een echte professional.
Vier buitenaardse wezens, X-1, X-2, X-3 en X-4, arriveren begin jaren zestig op aarde. Hier besluiten ze menselijke trekken over te nemen om de aardse wezens incognito te bestuderen, maar raken uiteindelijk betrokken bij het Romeinse 'dolce vita'.
In de nabije toekomst ontvouwt zich een oorlog tussen cyborgs en mensen in New York City. De plaatselijke sheriff moet de krachten bundelen met een gigantische replicant, van de Robotic Replicanten, om de stad te redden.
Een handjevol individuen - een journalist, een documentairemaker, een tienermeisje uit Roswell, een kolonel uit het leger, en een man die eerder voor jaren vermist is geweest - worden wakker in de woestijn van Area 51.