Gedreven door schuldgevoel omdat ze geen kind kan krijgen, besluit de vrouw zwanger te worden door te klonen. De dochter van wie zij bevalt, is dan ook vrijwel identiek aan haar. Het kind begint snel te groeien en vervangt langzaam de moeder in het huishouden.
De politie van Bangkok wordt geconfronteerd met een dodelijke bende die beschermd wordt door zwarte magie. Het is aan de jonge agent Yosthana en zijn sexy partner Duangdao om de 'Five Bullets-Bandit', geleid door de onsterfelijke Mahesak, op te sporen. Ook Yosthana beschikt over mystieke krachten maar om Mahesak te kunnen overwinnen, moet een oud en magisch zwaard, The Tiger Blade, gevonden worden.
Er zijn twee jaar verstreken sinds de Grote Oorlog. Akito en Yurika zijn verdwenen. De Jovians en de Earthlings hebben hun krachten gebundeld en Ruri is nu kapitein van Nadesico B. Naarmate de populariteit van Boson Jumping groeit, is er een uitgebreid transportnetwerk ontwikkeld. Dit netwerk van Chulip-portals, ook wel het Hisago-plan genoemd, bevat de antwoorden op de mysteries achter Bose-deeltjes en hun kracht. Als deze geheimen in de verkeerde handen vallen, kan dat grote problemen betekenen. En er zijn grote problemen. Een splintergroep van Mars heeft een offensief gelanceerd, waardoor de Verenigde Strijdkrachten verward en wanhopig achterblijven. Zo erg zelfs dat de voormalige bemanning van de Nadesico wordt teruggeroepen naar actieve dienst voor een speciale, niet-goedgekeurde missie: om ons allemaal te redden. Heeft deze menagerie van buitenbeentjes wat nodig is? Wie wint de race om de Boson-technologie? En wat is er in vredesnaam met Akito en Yurika gebeurd?