We bevinden ons in een wereld die is aangevallen door onbekende monsters die vele levensvormen in de wereld hebben weggevaagd, inclusief mensen. De overlevende soorten hebben de aardbodem verlaten en leven op een vliegend eiland genaamd Regal Ele. Willem Kumesh ontwaakt 500 jaar later boven de wolken, niet in staat degenen om wie hij gaf te beschermen. Als enige overlevende verzonk hij in wanhoop. Maar plotseling ontmoet hij een groep jonge meisjes en krijgt hij onverwacht een baan in wapenbeheer.
Om zijn moeder te redden, maken een goedhartige jongen en zijn speciale vriendje een reis door het post-apocalyptische Japan. Maar de duistere krachten komen dichterbij.
Ze zijn de volgende evolutionaire sprong voorwaarts van de mensheid, een generatie mensen geboren met paranormale vermogens - The Tomorrow People. John, Cara en Russell zijn een genetisch geavanceerd ras met de capaciteiten van telekinese, teleportatie en telepathische communicatie. Ze worden opgejaagd door een paramilitaire groep van wetenschappers die bekend staat als Ultra. Onder leiding van Dr. Jedikiah Price ziet Ultra de Tomorrow People als een zeer reële existentiële dreiging van een rivaliserende soort en de buitenstaanders zijn gedwongen zich te verschuilen in een verlaten metrostation net onder de oppervlakte van de menselijke wereld.
Een alien strijkt neer in de olievelden van New Mexico met een missie: hij moet de briljante wetenschapper Justin Falls vinden, de enige vrouw op aarde die kan helpen zijn soort te redden. Zelfs terwijl hij worstelt om zich aan te passen aan onze wereld en meer 'menselijk' te worden, kon haar vertrouwen in de mensheid niet lager zijn. Samen ontdekken ze dat om zijn wereld te redden, ze eerst haar wereld moeten redden.