Er is niet alleen frisse lucht in Black Lake, er gebeuren daar ook heel mysterieuze dingen... Valérie, een politieagent uit de stad, arriveert met haar zoon Dave om Adrien bij te staan, de politiechef van een klein dorp wiens partner is 3 weken vermist.
Haruka Asahina is een tiener op de middelbare school die racet in de Formule 4. Hij kruist het pad met een aangespoelde fotograaf, Kōya Madoka, die besluit Haruka te helpen zijn droom te verwezenlijken en het podium te bereiken. Het is druk en de concurrentie is hevig. Racen voor het door een familie gerunde Komaki Motors-team betekent dat Haruka de auto, en zichzelf, tot het uiterste moet drijven om de aandacht van topteams te trekken. Zet je schrap, het is tijd om te racen!
Het verhaal speelt zich af in het jaar 1937, aan de vooravond van de Tweede Wereldoorlog, en gaat over een mysterieuze spionageopleidingsorganisatie die bekend staat als de 'D Agency'. De organisatie is opgericht door luitenant-kolonel Yuuki van het keizerlijke Japanse leger. Zijn idealen brachten hem ertoe mensen te rekruteren die verder gingen dan alleen afgestudeerden van de militaire academie en personeel, terwijl hij hen opleidde tot bekwame agenten in de kunst van manipulatie. Deze agenten zouden een gespecialiseerd team worden om operaties uit te voeren. Eén van die antiheldenagenten, genaamd Jirou Gamou, gaat op een aangrijpende missie om geheime documenten met de titel 'Black Notes' te ontdekken, terwijl hij strijdt tegen krachten van binnen en buiten zijn eigen gelederen.