Mei Ayazuki, een gewoon middelbare scholiere, wordt het voorwerp van genegenheid voor een stel knappe historische figuren wanneer ze per ongeluk terugreist naar Tokio tijdens het Meiji-tijdperk.
Het verhaal speelt zich af op aarde, in een toekomst waarin enkele mysterieuze reuzen, bekend als 'Huge', vernietiging en angst hebben gebracht. De hele wereld verenigt zich tegen de dreiging van de reuzen en creëert speciale wapens genaamd 'CHARM' (Counter Huge Arms), gecreëerd dankzij de unie van wetenschap en magie. Deze wapens blijken bijzonder geschikt voor tienermeisjes genaamd 'Lilies'. Overal ter wereld worden lelies getraind in speciale kampen genaamd 'Gardens', om de mensheid te beschermen.
'Hundred' - dat is het enige wapen dat de mysterieuze levensvorm 'Savage' ervan kan weerhouden de aarde te bezoeken. De hoofdpersoon, Kisaragi Hayato, wil met deze Honderd een Martial Arts Master worden. Hij slaagde erin de slagschipuniversiteit Little Garden binnen te komen. Maar... 'Ik wilde je zien, Hayato!!!' 'H-Hoe weet je mijn naam?' Bij de huisgenoot, Emil Crossford, die hem op de een of andere manier goed kent (?), krijgt Hayato een ongemakkelijk gevoel. Bovendien wordt hij vlak na de toegangsceremonie voor een duel gevraagd door de sterkste vechtsportmeester van de campus, 'Koningin' Claire Harvey...!? De ultieme academiestrijd begint hier!
Six Gravity en Procellarum zijn twee rivaliserende mannelijke idoolgroepen die toevallig in hetzelfde studentenhuis wonen. Six Gravity bestaat uit jonge mannen die de maanden december tot en met mei vertegenwoordigen, terwijl de leden van Procellarum de maanden juni tot en met november vertegenwoordigen. Volg het dagelijkse leven van deze twaalf jonge mannen terwijl ze omgaan met de stress van afgoderij, school en samenleven.
Een middelbare scholier wiens jaren zonder vriendin van zijn leeftijd zijn, Keiki Kiryuu, ontvangt plotseling een liefdesbrief. Hij is blij dat hij eindelijk een vriendin kan hebben, maar is ook verbaasd omdat er niet alleen geen afzender op staat, maar ook wit ondergoed erbij zit…??? De schattige meisjes die zich om hem heen verzamelen zijn allemaal raar en met redenen!? Wie is de Assepoester die het ondergoed heeft gestuurd?