Al meer dan een eeuw beschermt de mysterieuze Hellsing Organization in het geheim het Britse Rijk tegen de ondoden. Toen Sir Integra Hellsing het hoofd van de organisatie werd, erfde ze ook het ultieme wapen tegen deze bovennatuurlijke vijanden: Alucard, een malafide vampier die mysterieuze en angstaanjagende krachten bezit. Nu moet Hellsing omgaan met een gevaarlijker dreiging dan vampiers.
Op een noodlottige dag werd de hele mensheid versteend door een verblindende lichtflits. Na enkele millennia wordt middelbare scholier Taiju wakker en raakt verdwaald in een wereld van beelden. Hij is echter niet de enige! Zijn wetenschapsminnende vriend Senku is al een paar maanden actief en hij heeft een groots plan in gedachten: de beschaving een nieuwe impuls geven met de kracht van de wetenschap!
Daigo Toake brandt van opmerkelijk talent en ongeëvenaarde vastberadenheid. Shun Onoda worstelt tegen de muren die zijn eigen pad blokkeren. Yuki Nakamura hoopt een van de weinige vrouwelijke leden te worden van het speciale reddingskorps dat bekend staat als 'Orange'. Wanneer deze drie jonge brandweerlieden, die het doel delen om lid te worden van Oranje, samenkomen, begint het verhaal van hoe Japan op een dag zal worden gered... en wat voor hen opdoemt is een crisis die het hele land in gevaar brengt!
Tijdens een toegangsceremonie voor de middelbare school merkt middelbare scholier Kotoko Aihara, die niet zo slim is, de knappe jongen Naoki Irie op. Ze wordt meteen verliefd op hem. Kotoko uit haar gevoelens aanvankelijk niet tegenover hem, maar krijgt eindelijk de kans om hem te vertellen hoe ze zich voelt. Helaas wijst Naoki Kotoko af en zegt: 'Ik hou niet van domme vrouwen.' Op een dag wordt het huis van Kotoko Aihara zwaar beschadigd door een aardbeving. Totdat het huis is herbouwd, besluiten Kotoko Aihara en haar vader bij haar vaders vriend te gaan wonen. Wanneer Kotoko Aihara naar haar nieuwe tijdelijke huis verhuist, is ze verrast om te horen dat Naoki Irie daar ook woont.
In de regio Kanto strijden leerlingen om van hun school de heerser van deze regio te maken. Sonsaku Hakufu, die net is overgestapt naar de Nanyou High School, kan niets anders doen dan een aantal middelbare scholieren in elkaar slaan. Hakufu, die de reïncarnatie is van een beroemde krijger uit de oudheid en die geen idee heeft van de betekenis van een Magatama, wordt echter al snel een bedreiging en de clan van de 4 keizers besluit hem te elimineren. Ondertussen is er net een groot toernooi begonnen om te bepalen welke school soeverein van Kanto zal worden...
Wanneer een draak een vredig dorp aanvalt, is het niet het beest dat inwoner Nikola in verwarring brengt, maar de man die hen te hulp schiet. Haga, lid van een geheim koninklijk team van onderzoekers, intrigeert haar met zijn excentrieke manieren. Het kan te wijten zijn aan het feit dat hij een echte QA-debugger is en dat deze wereld een VR-game is! Met Haga aan haar zijde raakt Nikola geïnspireerd om op pad te gaan en de ware aard van haar wereld te leren kennen.
Drie jaar zijn verstreken sinds de strijd met het White Comet Empire. President Dessler, die op zoek is naar een nieuwe moederster om het stervende Gamilas-volk te redden, vindt in een deel van het Melkwegstelsel een ster die aan de voorwaarden voldoet. Maar het bevond zich op het grondgebied van een machtige interstellaire natie. Bij het territoriale geschil dat in de Melkweg uitbrak, is onvermijdelijk de aarde betrokken, die een veiligheidsverdrag heeft met Gamilas. De magie van de tijdfout, die de aarde militaire en economische voordelen opleverde, is verdwenen in ruil voor hun eigen leven. Susumu Kodai vertrekt met de nieuwe bemanning op een trainingsreis ter voorbereiding op een naderende noodsituatie. Zonder te weten dat iemand die op zichzelf mikt, er middenin zit. Yamato staat op het punt een nieuwe reis te ondernemen in een tijdperk van ongekende angst. Onderweg wacht een onvoorstelbare nieuwe vijand...
Het is het jaar 1931. Prins Tokugawa Yoshinobu heeft de absolute controle over Japan. Overblijfselen van de cultuur uit het Meiji-tijdperk zijn overal in de stad te zien, maar ook de wetenschappelijke technologie en de Japanse esoterische kosmologie Onmyodo ontwikkelen zich. Maar achter de glitter schuilt Kuchinawa, een dissidente groep die de moord op de prins plant. De taak om deze dissidenten uit te roeien is aan Nue, de geheime moordenaars groep van de regering. Sawa Yukimura, die voor deze organisatie werkt, haar hele familie werd vermoord en ze wijdde haar leven aan het wreken van hun dood.
De wereld wordt getroffen door een mysterieuze ziekte. Hun oorsprong? Een ondergronds koninkrijk op Antarctica. Een jonge man die immuun is voor de ziekte gaat in zijn eentje op zoek naar een geneesmiddel. Maar verschrikkelijke geheimen en wezens wachten op hem...