Precies op tijd voor het vakantieseizoen verbindt deze film de oude Maya-voorspelling van wereldwijde vernietiging eind 2012 en het iconische lied, The 12 Days of Christmas. Maar er is hoop: een vader komt er achter, dat zijn dochter de 'uitverkorene' is en alleen zij kan de verdere vernietiging stoppen. Als hij de gestoorde stadsmensen kan stoppen, die haar de schuld geven van de vernietiging van de stad.
Een paar maanden nadat Seth Brundle de dood vond door Veronica's geweer, baart zij zijn zoon, Martin. Seth's werkgever adopteert Martin, om zo zijn genen te kunnen gebruiken voor een superleger. Een paar jaar later is Martin volgroeid, ondanks dat hij pas vijf is, en de vlieg in hem begint wakker te worden. Met de hulp van zijn vriendin Beth probeert hij hulp te zoeken.
2017. Sam Treadwell is ten einde raad. Bij zijn androïde vrouw Cherry 2000 zijn bij een vrijpartij in het afwaswater letterlijk de stoppen doorgeslagen. Hij huurt de sexy gids E. Johnson in om hem door Zone 7 te loodsen en een vervangend model te zoeken in een vervallen en onder zand bedekt Las Vegas.
Het is anno 3000. Een ruimtevrachtschip is op een interstellaire routinemissie. Onderweg ontdekken ze de verlaten ruimtetranssporter Demeter, die 100 jaar geleden als vermist werd opgegeven. Omdat de bemanning van het vrachtschip financieel krap zit, gaan ze aan boord om zo veel mogelijk van waardevolle vracht te claimen. Helaas heeft het schip een gevaarlijke blinde passagier.
Het pas getrouwde stel Paul en Bea reist voor hun huwelijksreis af naar een afgelegen meer in Canada. Kort na aankomst ontdekt Paul dat Bea gedesoriënteerd door de nachtelijke duisternis dwaalt. Als haar gedrag steeds vreemdere vormen begint aan te nemen heeft Paul het vermoeden dat er iets meer gebeurd is in het bos.
Op 21 december 2012 beginnen vier mensen (vreemden van elkaar), gedreven door geloof, aan een reis naar een oude tempel in het hart van Mexico. Voor de Maya indianen is deze dag de laatste vastgelegde dag.
In San Tiburon is een zwaar beveiligde gevangenis, bewoond door monsters, cyborgs en superschurken. Allen zijn uitgerust met schokbanden en apparatuur dat hun superkrachten dempt. De opzichter, directeur Devlin, is net zo verdorven als de gevangenen. Hij is geïnteresseerd in het onvindbare fortuin van Julius Loeb. De laatstgenoemde is de beruchtste gevangene en een supergenie dat zijn rijkdom niet zomaar afstaat. De fragiele rust in de gevangenis verandert in chaos met de komst van Payback, een moorddadige burgerwacht met bloederige bedoelingen. De orde wordt daarnaast officieel op zijn kop gezet als een slechterik met zijn elektrische gaven het gevangenissysteem platlegt.
De jonge Charlie McGee probeert erachter te komen hoe ze op mysterieuze wijze de krachten heeft verworven objecten met haar geest in vuur en vlam te kunnen zetten. Een schimmige overheidsorganisatie, genaamd The Shop, weet Charlie te traceren en probeert haar gevangen te nemen om te bestuderen en als wapen te gebruiken. Samen met haar vader gaat ze op de vlucht en proberen ze om uit handen te blijven van deze organisatie.
De jonge Victor Frankenstein vermoordt zijn eigen vader om diens geld en titel te kunnen erven. Die heeft hij namelijk nodig om zijn macabere experimenten met dode wezens te verwezenlijken.
In deze persiflage op 'Flash Gordon' (met een 'a') richt Emperor Wang the Perverted, heerser over planeet Porno, een seks-straal op de aarde, en iedereen verandert spontaan in seksmaniakken. Alleen de football-speler Flesh Gordon (met een 'e') kan de wereld nog van de totale ondergang redden.
In een futuristische samenleving waarvan elk facet gecontroleerd wordt door 'Big Brother' en waarin liefde is verboden, wordt een ambtenaar verliefd op een vrouw. Daarom moet hij worden gestraft.
Stillman is een genie in fysica die een relatie met Debbie heeft. Tot zij hem dumpt en hij ontredderd achterblijft. Hij komt op het idee een tijdmachine te bouwen om terug te keren naar de periode waar hun relatie nog intact was. Hij krijgt hierbij hulp van zijn goede vriend Evan.
Op drift in hun kapotte space shuttle met weinig hoop op redding, maken twee astronauten ruzie over of ze beter af zijn hun resterende dagen als vrienden door te brengen of iets meer.