Een bewerking van de originele vijfdelige boog van de populaire JoJo's Bizarre Adventure-manga, die de Phantom Blood-hoofdstukken beslaat. Jonathan Joestar is een aristocratische jongen wiens leven plotseling op zijn kop wordt gezet door de komst van een mysterieuze nieuwe jongen, Dio Brando. Dio heeft een band met zijn vader, en na verloop van tijd ontstaat er een rivaliteit als Dio geobsedeerd raakt door een mysterieus, oud en mystiek stenen masker dat Jonathans vader bewaart.
De planeten Iscandar, Gamilus en Aarde vechten samen tegen een nieuwe gemeenschappelijke vijand. Deze vijand is het Donkere Nevelrijk en zij willen bijzondere mineralen uit Iscandar en Gamilus ontginnen. Het Donkere Nevelrijk is haast onverslaanbaar met hun onverwoestbare ruimteschepen.