Kagura Tsuchimiya is eigenlijk een normale middelbare scholier en brengt gelukkige dagen door met haar twee vrienden Miku en Yacchi. Maar Kagura heeft een ongewone taak: samen met een speciale eenheid van de Environmental Protection Agency jaagt ze op demonen en geesten die mensen kwaad willen doen.
De jonge Jim Hawkins (Toby Regbo) is de enige die met een zeilschip een legendarisch eiland, dat bekend staat om zijn verborgen schatten, kan bereiken. Maar aan boord van het schip bevindt zich ook de mysterieuze kok John Silver (Eddie Izzard), wiens ware motivatie voor de reis er voor zorgt dat Jim twijfels krijgt tegenover de gehele bemanning.
Zes maanden geleden verloor Lord Hugh Disward (Huey) zijn excentrieke grootvader, Wes. Om het landgoed van Wes te erven, moet Huey de voogdij over de 'Mystic Archives of Dantalian' op zich nemen, die verboden kennis bevat en een mysterieus meisje genaamd Dalian. Dalian en Huey beginnen een onwaarschijnlijke samenwerking terwijl ze mysteries oplossen die zijn veroorzaakt door Phantom Books.
Originele Light Novel geschreven door Gakuto Mikumo en geïllustreerd door G-Yuusuke. Eerst aangepast aan manga door Chako Abeno, en opnieuw door Monaco Sena.