De reïncarnatie van Himiko, de voormalige koningin van Yamatai, heeft besloten oorlog te voeren tegen alle magatama-bezitters van Kanto. Om haar verloren koninkrijk terug te krijgen, moet ze de echte Drie Heilige Schatten van Japan verzamelen.
Wanneer Himiko's bondgenoot, Asaemon Yamada, meedogenloos de Nanyou Academie aanvalt - die het heilige zwaard bezit waar Himiko naar op zoek is - maakt Chuubou Sonken, de nieuwe zus van Hakufu Sonsaku, haar draak wakker, maar verliest het bewustzijn. Vastbesloten om haar broer of zus te redden, moet Hakufu haar magatama terugvinden in de Jofuku-tempel, een legendarische plek waar ze training zal krijgen die haar misschien haar leven zal kosten.
Terwijl de grens tussen de levenden en de doden in Jofuku begint te verdwijnen, zullen de krijgers van de Kanto-regio zich moeten verenigen om Himiko's mysterieuze plannen te dwarsbomen.
Hiromi Maiharu is net verhuisd naar Kamakura. Om van het prachtige landschap van de stad te genieten, besluit ze naar haar nieuwe middelbare school te fietsen. Het is echter lang geleden dat ze heeft getrapt! Onderweg ontmoet ze Tomoe, en de twee meisjes sluiten zich samen aan bij de fietsclub van de middelbare school.
Tokyo Butei High School is een speciale school waar gewapende rechercheurs, de Butei, worden getraind in het gebruik van wapens. Kinji Touyama is een tweedejaars student en heeft de bijzondere eigenschap dat hij, wanneer hij opgewonden raakt door het andere geslacht, bijna bovenmenselijke kracht ontwikkelt. Hij houdt dit echter geheim, zodat hij een gewoon, vredig leven kan blijven leiden. Op een dag wordt hij echter op weg naar school betrokken bij een bomaanslag en ontmoet vervolgens Aria H. Kanzaki, waardoor er abrupt een einde komt aan zijn vredige schooltijd.