Na een wereldwijde catastrofe twijfelt de laatste man op aarde aan zijn doel en gezond verstand, terwijl zowel zijn overleden vrouw als een mysterieuze vreemdeling hem confronteren met zijn verleden, zijn heden en welke toekomst er ook nog overblijft in de woestenij van een dode wereld.
Drie jaar voordat het verhaal begint, verschijnt er een groot ruimteschip boven Tokio. Er volgt een eenzijdige oorlog tegen de ogenschijnlijk onschuldige buitenaardse wezens, die tot controverse en pacifisme leiden. Ondanks deze unieke en tragische gebeurtenis gedragen middelbare scholieren Koyama Kadode en Nakagawa Ouran zich alsof er niets is veranderd. Ze leven hun dagen zoals ze altijd hebben gedaan. De focus van dit verhaal ligt niet op de invasie van buitenaardse wezens, maar op de menselijke natuur, de dialoog, het opgroeien en het leven.
Nadat een jonge vrouw hoort dat haar jongere zus een zeldzame ziekte heeft, neemt ze de wanhopige beslissing om op alle mogelijke manieren geld te krijgen voor een levensreddende procedure.