Het verhaal van een Karamakate, een sjamaan uit de amazone, en twee wetenschappers die samen over een tijd van veertig jaar werken om te zoeken naar een heilige plant die geneest.
Voormalig wonderkind Frank, getekend door teleurstelling, en Casey, een pientere, optimistische tiener die barst van de wetenschappelijke nieuwsgierigheid, delen hetzelfde lot. Samen gaan ze op een gevaarlijke missie om de geheimen te onthullen van een mysterieuze plek die zich in een andere dimensie bevindt, en alleen bekend staat als Tomorrowland. Na wat ze daar moeten doen zal de wereld — en zijzelf — nooit meer hetzelfde zijn.
In de nabije toekomst is de aarde verlaten en gevaarlijk geworden. Nu bewoond door een mysterieus ras van schepselen, is de mensheid gedwongen om zijn toevlucht te zoeken in de SkyArk, een door de mens gemaakte stad aan de hemel.
Op een warme zomerdag hoorde een jongen het geluid van klokken luiden, alsof hij een feest vierde, in de berg vlakbij zijn huis. Enkele jaren later stuit de mushishi Ginko op diezelfde berg op een jong meisje in een berg met takken en bladeren die uit haar lichaam groeien. Hij realiseert zich later dat zij de heer van die berg is, maar vindt het vreemd dat een mens als zij tot heer werd gekozen. Hij ontmoet haar oudere broer die haar blijft zoeken sinds ze verdween terwijl hij hem vergezelde op een stormachtige dag. Het verhaal gaat over Ginko's eigenaardige reis te midden van het occulte om het mysterie achter het enigmatische meisje genaamd Kaya en de berg die haar thuis is geworden te ontrafelen.
Mari, Sadu, Olav en Anton vormen een geheim clubje in Tartu dat spelletjes speelt die verzonnen worden door Mari's opa. Een stadsfeest verandert in chaos als er een gevaarlijk gif verspreid wordt waardoor volwassenen zich gaan gedragen als kinderen.