Het verhaal is opgedeeld in twee delen. Aan de ene kant hebben we Ryouma Sengoku en zijn verleden, zijn obsessie, zijn relatie met Takatora Kureshima en de oprichting van de Sengoku Drivers en de Genesis Drivers. In het midden komt er een vreemde dreiging naar de stad die zijn eigen creatie gebruikt, waarbij iemand uit het verleden degene zal zijn die de stad zal confronteren. Aan de andere kant is de strijd tussen Kouta en Kaito voorbij en besluit iedereen door te gaan met hun leven . Zack begint aan zijn reis naar New York om een professionele danser te worden, maar een telefoontje zal zijn lot veranderen als iemand zich de naam van Team Baron toe-eigent. *Gelegen in het midden van de serie en aan het einde, zonder een specifieke plaats.
Parijs, 1941. Napoléon V is de heerser van Frankrijk. Wetenschappers verdwijnen op mysterieuze wijze. De wereld heeft de overstap naar moderne technologie nooit gemaakt, waardoor alles nog steeds wordt aangedreven door kool en stoom. In deze omgeving zoekt April naar haar ouders, die beide wetenschapper zijn, en ook spoorloos zijn verdwenen. Samen met haar pratende kat Darwin en jonge schelm Julius trotseert ze de gevaren van haar sterk vervuilde rijk.
Wanneer ze per ongeluk naar het Jurassic-tijdperk worden getransporteerd, moeten de Teenage Mutant Ninja Turtles hun weg vinden door prehistorische dinosaurussen om naar huis terug te keren, terwijl ze worden geconfronteerd met gevaarlijke buitenaardse wezens uit de toekomst die een snode plan voor hen hebben. Maar de zaken worden nog ingewikkelder met de komst van Triceratons, Bebop en Rocksteady.
Vóór het tijdperk van het Laser Men-verzet probeert een ambitieuze krijger met de hulp van zijn partners een innovatief verschil te maken met de wapens die ze hebben gebruikt in de jarenlange strijd tegen de huurlingen die hun thuisland hebben overgenomen. Gedurende deze hele reis worden zijn karakter en motieven op de proef gesteld door familieproblemen en teamloyaliteit.