Nadat een man dood wordt aangetroffen, ontvangen vijf verschillende mensen, onder wie drie geleerden, een verslaggever en de broer van de overledene, een envelop met daarin details over een naderende invasie van een buitenaardse levensvorm. Voordat men weet wat er eigenlijk aan de hand is, blijken er nog drie van hen in leven te zijn. Er ontstaat een race tegen de klok om de ophanden zijnde invasie een halt toe te roepen.
In een futuristische samenleving worden mensen bij hun geboorte geselecteerd als soldaat te worden. Ze worden vervolgens tot onmenselijke moordmachines getraind. Eén van de meest succesvolle en oudste soldaten moet de strijd aangaan met een nieuwe lading soldaten. Op de planeet ontmoet hij de inwoners, die er een vredig leven leiden. Deze vrede wordt verstoord wanneer de planeet aangevallen wordt door de nieuwe supersoldaten die de kolonie willen uitschakelen. Todd beseft dat de inwoners in gevaar zijn en hij beslist om hen te helpen.
De Britse agent John Steed onderzoekt een plot van aartsvijand Sir August de Wynter om met zijn weermachine over de wereld te heersen. Steed onderzoekt de mooie Emma Peel, die verdacht wordt van samenspanning met de vijand, maar wordt verliefd op haar, wat alles alleen nog maar gecompliceerder maakt.
Mike moet de Tall Man noodgedwongen volgen naar een parallelle dimensie waar hij voor de laatste keer de strijd met hem kan aanbinden. Ondertussen komt Mike ook te weten wat er met zijn broer is gebeurd en probeert Reggie te ultieme transformatie van de Tall Man te voorkomen.
Alan, zoon van een speelgoedwinkel-eigenaar, probeert een paar nieuwe actie-figuurtjes uit: De Commando Elite en de Gorgonites. Hij weet echter niet dat deze speeltjes ontworpen zijn om te bewegen en te praten. De fabrikant heeft echter zeer intelligente militaire computerchips gebruikt, waardoor de poppen in staat zijn te leren. Een veldslag tussen de Commando's en de Gorgonites staat op het punt te beginnen.
Een gigantische meteoriet zal over 18 dagen inslaan op aarde. NASA roept de hulp in van Harry Stamper, een boor-expert, om de astronauten te trainen. Harry denkt echter dat de astronauten niet op tijd getraind kunnen zijn, en besluit zelf met z'n crew de klus te gaan klaren.
Twee tegenpolen, de "open-minded" Fox Mulder, en de sceptische Dana Scully, werken al enkele jaren bij de FBI aan de X-Files: onopgeloste zaken met een bovennatuurlijke tintje. Door de constante conflicten die ze hierbij hebben met hun superieuren zijn de X-Files onlangs gesloten, waarna Mulder en Scully op een bommelding gezet worden.
Dr. Magrew en zijn dochter Jane hebben de legendarische poppen van poppenspeler André Toulon overgenomen en zijn ondertussen druk aan het experimenteren met nieuwe poppen. Als Magrew dan de niet al te snuggere Robert Wisley ontmoet en ziet wat deze jongen met zijn handen kan, besluit hij Robert een baan aan te bieden waarin hij poppen mag maken. En terwijl Jane langzaam maar zeker gevoelens begint te krijgen voor haar vaders nieuwe werknemer, heeft Dr. Magrew hele andere plannen met de jongen.
Door jarenlange atoomproeven in de Stille Oceaan is een enorm beest ontstaan: Godzilla. Het meest legendarische filmmonster is wakker en stevent recht op New York City af! De Amerikaanse regering stelt direct een onderzoeksteam samen. Nick Tatopoulos (Matthew Broderick) maakt deel uit van dit team. Zijn taak: onderzoeken wat Godzilla naar New York City heeft gedreven. Nick gaat samen met het leger achter het enorme beest aan, met maar één doel: Godzilla vernietigen voordat hij alles en iedereen verplettert!
De 14-jarige Leo Beiderman ontdekt bij stom toeval een nieuwe komeet. De ambitieuze journaliste Jenny Lerner krijgt er lucht van en ziet de primeur als een handig carrièrezetje, want, zo maakt de eerste zwarte president Tom Beck bekend: de mensheid heeft nog maar een paar maanden te gaan. Als noodoplossing wordt een gigantische onderaardse schuilkelder aangelegd waar één miljoen uitverkorenen de jarenlange winter die de komeetinslag zal veroorzaken, kunnen overleven.
Astronauten Dennis Gamble (Mykelti Williamson) en Patrick Ross (Justin Lazard) maken deel uit van de eerste bemande missie naar Mars. Ross raakt daar geïnfecteerd met een buitenaards wezen en begint langzaam te muteren. Wanneer ze terugkeren op Aarde moeten de overgebleven teamleden uit de eerste film samenwerken met de nu vriendelijke, genetisch gemanipuleerde Sil (Henstridge) om hem te pakken te krijgen.
De natuurlijke energiebronnen van planeet Aarde raken stilaan uitgeput. Een oplossing dringt zich op, want overleven op de blauwe planeet dreigt onmogelijk te worden. De Jupiter-missie om de planeet Alpha Prime te koloniseren, lijkt het enige alternatief. Wetenschapper Jack Robinson, zijn vrouw, zijn gezin en gevechtspiloot Don West zetten dan ook koers naar de enige andere planeet waarop leven mogelijk is. Hun doel is een hyperpoort rond Alpha Prime te creëren om er op die manier voor te zorgen dat alle aardbewoners snel geëvacueerd kunnen worden, zonder rekening te moeten houden met het feit dat ze eerst lichtjaren in de ruimte vast zouden zitten. Hun plannen worden echter gedwarsboomd door dokter Smith die zo zijn eigen doel heeft om de missie naar Alpha Prime te dwarsbomen.
John Murdoch wordt alleen wakker in een hotel. Hij is z'n geheugen kwijt, en wordt gezocht voor een aantal bizarre moorden. Terwijl hij probeert om z'n verleden te achterhalen komt hij er achter dat er een groep wezens is die de gehele wereld om hem heen controleert.
De Amerikaanse zeemacht stuit op de bodem van de Stille Oceaan op een mysterieus ruimteschip dat meer dan 300 jaar geleden is neergestort. Psycholoog Norman Goodman, de wiskundige Harry Adams, biochemicus Beth Halperin en astrofysicus Ted Fielding, die deel uitmaken van een gouvernementele missie, krijgen de opdracht de vreemde structuur van het wrak te bestuderen.
Wanneer een stel meedogenloze kapers het meest luxe cruiseschip ter wereld overvalt, komen ze tot de schokkende ontdekking dat iedereen aan boord op mysterieuze wijze verdwenen is. Zonder dat ze het kunnen zien worden ze door iets angstaanjagends gadegeslagen: een allesverslinderd monster dat vanuit zee de met afschuw vervulde indringers vermoordt. Met man en macht doen ze er alles aan om te ontsnappen van het cruiseschip.
In het vreedzame dorpje Snowfield, Colorado heeft iets kwaadaardigs de hele gemeenschap uitgeroeid. Het is nu aan een groep mensen om het kwaad te stoppen, of in ieder geval om er levend vandaan te komen.
Nadat in 2013 een oorlog het grootste deel van Amerika vernietigd heeft, wordt een eenzame reiziger gevangen genomen door de militaire groep The Holnists. Wanneer hij weet te ontsnappen vind hij een achtergelaten postzak en -uniform, en begint hij de post te bezorgen.