Het avontuur begint met het verschijnen van Mewtwo, een genetisch gemanipuleerde Pokémon, gecreëerd uit het DNA van Mew, de zeldzaamste van alle Pokémon. Mewtwo is vastbesloten om zijn superioriteit te bewijzen en verleidt Ash, Pikachu en de anderen in een strijd, zoals er nog nooit is geweest: Mewtwo tegen Mew, superkloon tegen Pokémon. Het gaat hier om de ultieme confrontatie met de toekomst van de wereld als inzet.
Lord Conquer is een leider van een machtige clan, die de hele wereld wil veroveren. Om dit te realiseren voorspelt de ziener Mud Buddha dat hij over tien jaar een duel aan moet gaan met zijn aartsvijand Sword Saint. Ook vertelt Mud Buddha hem over Wind en Cloud, twee jonge kinderen die hem kunnen helpen de wereld te veroveren. Hij laat hun ouders vermoorden en voedt de twee kinderen zelf op. Maar de dingen gaan mis als Conquer zijn dochter uithuwelijkt aan Wind, hierdoor zet hij Wind en Cloud tegen elkaar op. Uiteindelijk komen Wind en Cloud erachter dat Conquer hun ouders vermoord hebben en hij de twee alleen maar gebruikt heeft voor zijn doel, en dan rest hun nog maar een ding en dat is hun vroegere meester verslaan.
Het is twintig jaar geleden sinds Don Diego De La Vega zijn laatste heldendaad als Zorro heeft verricht. Maar de onderdrukking duurt voort en hij zal een opvolger moeten vinden die wil vechten voor het Mexicaanse volk. Hij neemt Alejandro Murietta onder zijn hoede, een struikrover met een 'vaag' verleden. Samen met Murietta wordt Zorro de grootste held die De La Vega eens was. Samen strijden ze voor de vrijheid van het volk en de waarheid omtrent de afkomst van de mooie Elena...
Alan, zoon van een speelgoedwinkel-eigenaar, probeert een paar nieuwe actie-figuurtjes uit: De Commando Elite en de Gorgonites. Hij weet echter niet dat deze speeltjes ontworpen zijn om te bewegen en te praten. De fabrikant heeft echter zeer intelligente militaire computerchips gebruikt, waardoor de poppen in staat zijn te leren. Een veldslag tussen de Commando's en de Gorgonites staat op het punt te beginnen.
De rechercheurs Martin Riggs, Roger Murtaugh en Lorna Cole zijn terug, samen met de hyperactieve Leo Getz. Het viertal wordt ditmaal bijgestaan door assistent-rechercheur Lee Butters in hun onderzoek naar de mensensmokkel die georganiseerd wordt door een Aziatische misdaadorganisatie. Ze worden al snel geconfronteerd met Wan Sing Ku, de harde man in de organisatie. Dan blijkt al snel dat het oprollen van deze Chinese maffia-bende een zware, dodelijke klus zou kunnen worden voor Riggs en Murtaugh.
Een gigantische meteoriet zal over 18 dagen inslaan op aarde. NASA roept de hulp in van Harry Stamper, een boor-expert, om de astronauten te trainen. Harry denkt echter dat de astronauten niet op tijd getraind kunnen zijn, en besluit zelf met z'n crew de klus te gaan klaren.
Tijdens een romantisch uitje op een tropisch eiland met haar vriend besluit Robin Monroe om haar magazine te helpen door een interessant verhaal op een nabij gelegen eiland te coveren. Het enige vliegtuig op het eiland wordt bestuurd door Quinn Harris, een stevige drinker.
Jack heeft jaren in de persoonlijke bescherming gewerkt en een vriend met een casino vraagt hem om op diens dochter te passen zo lang er problemen zijn. De vriend komt echter om bij een ongeluk, zodat Jack voor het meisje moet zorgen. Als een andere vriend in het ziekenhuis belandt met een kogelwond, neemt hij diens opdracht over om een fotomodel te beschermen. Een fanaat heeft het voorzien op het model en maakt gebruik van de wetenschap dat Jack fobisch is voor alles wat wit is.
Black en Blue zijn twee kleine criminelen die vanuit hun bestelwagen T.V.'s en stereo's verkopen. Wanneer een bezorger een lading mobiele telefoons verkeerd bezorgd besluiten zij daar een slaatje uit te slaan. Met behulp van een plaatselijke hacker en een sexy secretaresse loopt het geld binnen, maar dan krijgen ze het aan de stok met een grote crimineel.
Door jarenlange atoomproeven in de Stille Oceaan is een enorm beest ontstaan: Godzilla. Het meest legendarische filmmonster is wakker en stevent recht op New York City af! De Amerikaanse regering stelt direct een onderzoeksteam samen. Nick Tatopoulos (Matthew Broderick) maakt deel uit van dit team. Zijn taak: onderzoeken wat Godzilla naar New York City heeft gedreven. Nick gaat samen met het leger achter het enorme beest aan, met maar één doel: Godzilla vernietigen voordat hij alles en iedereen verplettert!
De 14-jarige Leo Beiderman ontdekt bij stom toeval een nieuwe komeet. De ambitieuze journaliste Jenny Lerner krijgt er lucht van en ziet de primeur als een handig carrièrezetje, want, zo maakt de eerste zwarte president Tom Beck bekend: de mensheid heeft nog maar een paar maanden te gaan. Als noodoplossing wordt een gigantische onderaardse schuilkelder aangelegd waar één miljoen uitverkorenen de jarenlange winter die de komeetinslag zal veroorzaken, kunnen overleven.
Ex-gevangene Jack Crews neemt een baan als vrachtwagenchauffeur. Hij rijdt door de gehele Verenigde Staten heen. Crews rijdt, zonder dat hij het beseft, met illegale wapens aan boord, die zijn corrupte baas Red wil verkopen. Als Crews weigert zijn lading te laten jatten door zijn baas, wordt zijn dochtertje ontvoerd en moet hij haar zien te redden.
Melvin Smiley is een jonge, succesvolle huurmoordenaar. Samen met 3 maatjes besluit hij Keiko. de dochter van een rijke Japanse zakenman, te kidnappen. Ze weten echter niet dat deze net bankroet is gegaan. Bovendien is zijn dochter peetdochter van Paris, de baas van de 4, die op zoek gaat naar de kidnappers. Ondertussen worden Keiko en Melvin verliefd.
Astronauten Dennis Gamble (Mykelti Williamson) en Patrick Ross (Justin Lazard) maken deel uit van de eerste bemande missie naar Mars. Ross raakt daar geïnfecteerd met een buitenaards wezen en begint langzaam te muteren. Wanneer ze terugkeren op Aarde moeten de overgebleven teamleden uit de eerste film samenwerken met de nu vriendelijke, genetisch gemanipuleerde Sil (Henstridge) om hem te pakken te krijgen.
Daniel is een pizzabezorger in Marseille. Hij verandert van baantje, en wordt taxichauffeur. Als hij gepakt wordt wegens veel te hard rijden, stemt hij toe om de sukkelige politieagent Emilien te helpen. Emilien is op het spoor van een groep Duitse bankrovers.
Een beginnende huurmoordenaar, die financieel in de problemen zit, neemt met tegenzin de taak op zich om de geplande moordenaar van een Japanse tycoon te vinden.
Een negen jarige autistische jongen heeft onbewust een zeer geheime code van het Amerikaanse leger gekraakt. Luitenant Nicholas Kudrow (Alec Baldwin) wil hem in het belang van de nationale veiligheid laten vermoorden. Maar hij heeft één probleem, de jongen wordt geholpen door FBI agent Art Jeffries (Bruce Willis).