Oom Erik past op de kinderen omdat zijn zus op vakantie is. De kinderen zorgen direct voor problemen als ze de auto van hun vader in de prak rijden. Om geld te verdienen voor de reparatie halen ze hun oom over om het huis in een hotel te veranderen. In het hotel ontvangen ze gasten uit Japan, Denemarken en Oost-Europa. Sommige van hen zien er een beetje verdacht uit. Zouden ze iets willen stelen? De kinderen zetten alles op alles om het hotel en de opbrengsten voor de reparatie van de auto in veiligheid te stellen.
Scrat de eekhoorn zoekt naar een plaats om zijn noot te verstoppen. Hij veroorzaakt echter een scheur in de berg. Hierdoor valt hij in het centrum van de aarde. Dat is een draaibare, massieve bol. Scrat loopt op de draaiende bol en veroorzaakt een continentale drift. Hij creëert tevens fictief een beeld op Paaseiland, de Sfinx van Gizeh en de beelden in Mount Rushmore. Ten slotte wordt hij opgespannen rond de bal waardoor hij hoog in de lucht schiet wanneer hij loslaat. Vervolgens valt Scrat terug naar beneden en zijn de continenten weggedreven vergelijkbaar met de eerste korte film. Hij valt echter niet in de oceaan maar op een klein stuk achtergebleven ijs samen met zijn noot. Door de klap breekt het stukje ijs echter waardoor Scrat wegdrijft van zijn noot.
afleveringen Contact (afl. 4) en Lost and Found (afl. 10)
Als Karl in een aangespoeld schip een radio vindt, denkt hij dat hij daarmee een weg van het eiland in handen heeft. Hij kan immers via de radio om hulp roepen. Sommige bewoners, waaronder broer David, zijn het daar echter niet mee eens, omdat ze vinden dat het bestaan van Dinotopia een geheim moet blijven. Karl staat voor een dilemma…
In Lost and Found belandt Karl na een ongeluk met een Skybax gewond in een bos. Als David hoort dat zijn broer vermist wordt gaat hij direct met zijn vader op pad om hem te zoeken. Ondertussen loopt Karl een groepje zonderlinge figuren tegen het lijf, die niet weten dat er een bewoonde wereld is buiten het bos en het dorp waarin zij leven.
De film vertelt het verhaal van de twaalfjarige Storm Voeten, zoon van drukker Klaas Voeten, die in het geheim verboden lectuur drukt. Als Klaas door de Inquisitie wordt betrapt tijdens het drukken van een belangrijke brief van Maarten Luther, wordt Storm ongewild het middelpunt van de jacht op deze brief. Bedreigd door de Inquisitie en geholpen door Marieke, een katholiek weesmeisje uit de ondergrondse tunnels, moet Storm in een race tegen de klok zijn vader zien te redden van de dood als ketter.
Momoko's leraar vraagt de derde klas om een tekening te maken op basis van hun favoriete liedje, om mee te doen aan een wedstrijd. Ze kiest een liedje waar ze onlangs dol op is geworden tijdens de muziekles, en wil er graag een goede tekening van maken. Op weg om familieleden in Shizuoka te ontmoeten, ontmoet Momoko Shoko Kimura, een universiteitsstudent die af en toe portretten tekent en van plan is deel te nemen aan een kunstwedstrijd. Momoko en Shoko worden goede vrienden en inspireren elkaar uiteindelijk allebei op hun eigen manier.